不同品牌的明目地黄丸有效成分相同，疗效上也相差无几，所以很难准确说哪个品牌的明目地黄丸比较好，因此患者选哪一种牌子的明目地黄丸都是可以的。各个品牌之间，由于受生产工艺、原料价格、广告宣传、包装规格等因素影响，价格上也会有高、有低，患者可以根据自身经济条件，选择合适的品牌进行购买。

明目地黄丸含有白芍，根据中药“十八反”的合用禁忌，不宜与藜芦及含有藜芦的制品合用，如三七血伤宁胶囊、神州跌打丸等。本品中的石决明富含金属元素，不宜与红霉素、罗红霉素等大环酯类抗菌药，以及奎尼丁、异烟肼、喹诺酮类、四环素类等药物合用，以免形成难溶性络合物而影响药效。