许多药物在室温下通常能存放1-2年，但有一些药物，特别是液体制剂和注射剂，其保质期可能更短，一般为6个月至1年之间。患者在使用酪酸梭菌活菌散前应仔细阅读说明书，明确药物的保质期限和储存条件。如果药物过期，则不可使用，因为过期的药品不仅疗效降低，还有可能对人体造成危害，导致一些毒副作用。

酪酸梭菌活菌散属于益生活菌制剂，不宜与大部分的抗菌药合用，如氨苄青霉素、头孢唑林、头孢呋辛、四环素、氯霉素、呋喃唑酮、复方新诺明、氟哌酸等。因为抗菌药有抑制、杀灭细菌的作用，可抑制本品活菌在肠道发挥作用，也受本品的消耗而降低原本的抗感染效果。所以，酪酸梭菌活菌散与抗菌药不应在同时服，必要时可以间隔2-3个小时先后服。

除了口服药，也谨慎将酪酸梭菌活菌散与其他颗粒剂、口服液等混合冲泡，否则有可能发生配伍禁忌，使药物在体外就发生了相互作用，影响原本药物的性质与作用。总之，患者需本品与其他任何药物合用时，宜先咨询医生或药师，获得允许后再行合用，减少合并用药风险。

服药时需注意，酪酸梭菌活菌散需用温开水冲泡后服，水温不得高于42℃，以免活菌失效。冲调时，建议先将温开水倒入杯中，再将药粉倒入水中，搅拌溶解，这样可以防止药粉溶解时结块。