复旦大学附属中山医院是一所大型综合性三级甲等医院，在心脏、肝脏、肾脏、肺脏、消化道、泛血管等领域的临床能力处于国内顶尖、世界先进水平。医院以优势学科辐射带动多个高质量的特色学科群协同并进，拥有1个国家疑难病症诊治能力提升工程——心脑血管疾病，4个国家重大疾病多学科合作诊疗能力建设项目——消化道肿瘤、心脏瓣膜病、重症肺炎、早期认知障碍疾病，有国家公共卫生和重大疫情防控救治体系建设项目，国家重点学科（呼吸）发展项目。医院有国家临床重点专科建设项目20个，上海市重点学科与专科43个，院内成立了31个以疾病为中心的多学科临床诊疗中心。拥有国家临床重点专科建设项目20个，上海市“重中之重”临床医学中心3个，上海市“重中之重”临床重点学科3个，上海市医学重点学科13个，上海市临床重点专科22个。

医院拥有自主研发的一体化智慧医疗信息系统，实现了“服务人性化+资源功能化+业务智能化”的战略目标。