藤黄健骨丸的临床治疗效果还是比较明显的。一般来讲，大多数药品都是经过研发人员临床三期试验，在其安全性、有效性上有确切的实验数据后，再经国家药品监管机构批准上市，才能在市面上流通，也有很多药物还要在上市后通过临床四期试验，考察药物广泛使用后的疗效和不良反应。因此，药物没有好坏之分，只有对症与不对症，对症的药物才能治好疾病。

藤黄健骨丸含有莱菔子，莱菔子有消胀下气的功效，与补气的人参合用后，会降低人参补气的作用，因此患者不宜将本品与人参及含有人参的中成药合用，如人参健脾丸、人参养荣丸、乌鸡白凤丸等。

藤黄健骨丸与其它药物也可能发生药物相互作用，影响药效或出现药物毒副作用，因此为保证用药安全，患者服用本品期间若需要合用其它药物，请先咨询医生。