复旦大学附属中山医院消化内科是卫生部专科医师培训基地、国家药品监督管理局中山医院临床药理基地单位、内科博士点和博士后流动站，2010年获卫生部首批临床重点专科建设项目。

复旦大学附属中山医院消化内科由著名内科学家林兆耆教授于1953年创立，目前科室医师有42名，包括教授（主任医师）14名、副教授（副主任医师）10名、主治医师13名； 其中获博士学位35人。数位教授担任学会主任、常委及副主任委员，其中沈锡中教授担任上海医学会消化专业委员会主任委员、中国中西医结合肝病学会副主任委员，17名中青年骨干在学会各学组任职。

复旦大学附属中山医院消化内科设有两个独立的病区，共有核定床位106张，急诊周转部床位19张，年出院人数逾6500人次。专科门诊每周6天，同时设有脂肪肝、慢性肝病、食管胃静脉曲张随访、食管疾病、炎症性肠病、肠道微生态治疗、肿瘤治疗不良反应、幽门螺杆菌感染等多个专病门诊，年门诊人数逾34万人次。

复旦大学附属中山医院消化内科开设专家门诊和普通门诊，每周6天。专科门诊涵盖肝病、胃肠病、胰腺病、肠外营养等方面的诊疗服务。

复旦大学附属中山医院消化内科拥有先进的消化内镜设备和技术，能够进行各种消化道疾病的诊断和治疗，包括食管、胃、十二指肠、小肠、结肠、胆道和胰腺等部位的内镜检查和治疗。

复旦大学附属中山医院消化内科在消化系统肿瘤的诊断和治疗方面具有较高的水平，能够进行各种消化道肿瘤的综合治疗，包括手术、放射治疗、化学治疗、介入治疗和靶向治疗等。

复旦大学附属中山医院消化内科在肝硬化门诊方面具有较强的优势，能够为肝硬化患者提供全面的诊断和治疗服务，包括肝功能评估、门静脉高压并发症的防治、肝癌的筛查和治疗等。

复旦大学附属中山医院消化内科在消化系统功能检查方面也具有较高的水平，能够进行各种消化系统功能检查，包括食管压力测定、胃排空测定、胆汁反流检测、胃酸分泌测定等。

复旦大学附属中山医院消化内科在基础和临床科研方面也取得了显著的成绩，主持包括国家自然科学基金课题、国家863计划、上海市重点课题等在内课题，近5年获国家自然科学基金项目20余项；其它各类省部级基金21项，以通讯作者和通讯作者单位发表SCI论文超过200篇，其中多篇收录于Lancet、Hepatology、Journal of Hepatology、Endoscopy等影响因子20以上的全球顶级期刊。曾获国家科技进步二等奖奖、上海市科技进步一等奖、教育部科技进步二等奖、中华医学科技奖三等奖等重大奖项。