肚脐下三指处疼痛可能是由于以下原因导致的：胃肠功能紊乱、炎症、肿瘤以及先兆流产。对于每种可能的原因，下面是详细解释：

1. 胃肠功能紊乱：

胃肠功能紊乱可能是由于吃了生冷不干净的食物、暴饮暴食或者腹部受凉等原因引起的。这会导致肠痉挛和便秘等症状，通常伴随着肚脐下三指疼痛和腹胀感。

2. 炎症：

炎症可能是由于致病因素刺激小腹内的神经和脏器黏膜导致的。某些炎症疾病如前列腺炎、膀胱炎、阑尾炎和盆腔炎等也会引起肚脐下三指处疼痛的症状。

3. 肿瘤：

患有肿瘤（如前列腺肿瘤、子宫肿瘤和膀胱肿瘤）会导致占位效应，这也会引起肚脐下三指处的疼痛。在检查中可能还会发现肿物。

4. 先兆流产：

若患者处于妊娠期，肚脐下三指处的疼痛可能是先兆流产的症状。此时需要及时就医以获得适当的处理。

针对肚脐下三指处疼痛，建议您积极前往正规医院进行相关检查，明确病因，并接受有针对性的治疗。