打黄体酮两个月后臀部出现疼痛可能有以下几个原因：

1. 肌注部位形成硬结：由于黄体酮的液体较浓稠，在注射时可能导致局部形成硬结。即使两个月后注射部位仍然存在硬结，也可能导致臀部疼痛。这属于正常现象。

2. 腰椎间盘突出症：如果患者本身就患有腰椎间盘突出症，可能会导致腰痛和坐骨神经痛，从而引起打黄体酮两个月后臀部疼痛的症状。

3. 筋膜炎：如果患者患有筋膜炎，可能会导致局部疼痛和肌肉僵硬，也可以是臀部疼痛的原因。

除了以上原因外，打黄体酮两个月后臀部疼痛还有可能是其他原因引起的。为明确病因并进行相应的治疗，建议及时就医。