对于直径为3毫米的肾结石，我们可以通过物理方法和药物治疗来解决问题。

首先，我们建议患者多摄入富含纤维素和维生素的食物。纤维素可以增加肠道蠕动，促进排泄物的顺利排出，而维生素则有助于增强身体免疫力。建议患者增加大量的水果、蔬菜、全麦食物等纤维素丰富的食物，同时摄入适量的富含维生素的食物，如绿叶蔬菜、柑橘类水果等。

其次，患者应该保持充足的水分摄入，并加强排尿。喝更多的水可以稀释尿液，减少结石形成的风险；此外，频繁排尿可以促使结石更容易被排出。因此，建议患者每天摄入足够的水，并尽可能多尿。

此外，适量进行身体活动也有助于结石的排出。患者可以选择一些适合自己的有氧运动，如跳绳、跳高等，这些运动可以增加腹压，促进结石的移动和排出。但请注意，活动的强度和时间不宜过大，以免引发其他健康问题。

最后，如果结石无法通过自然排出，我们还可以考虑使用碎石类药物来改善病情。这些药物可以分解结石、促进结石的溶解和排出。但是，使用碎石类药物需要在医生的指导下进行，因为不同人的病情和身体状况可能有所不同。

在饮食方面，患者需要避免食用油腻食物和高草酸含量的食物。油腻的食物可以导致身体脂肪代谢紊乱，增加结石形成的风险；高草酸含量的食物（如草莓、菠菜等）则会增加尿液中草酸盐的浓度，使结石更易形成。因此，患者需要尽量避免这些食物的摄入。