在怀孕5周时，孕囊的正常大小大约为7毫米左右。在女性的输卵管内，精子和卵子结合形成受精卵，只有当受精卵成功着床于子宫内后，才会逐渐发育成为孕囊。因此，在孕5周进行B超检查时，孕囊相对较小，大致只有7毫米左右大小。

为了准确判断宫内早期怀孕或排除宫外孕的情况，建议进行阴道彩超检查。在此过程中并不需要憋尿，这样可以获得更为清晰的图像，从而早日确定孕囊的情况。

然而，如果在孕5周时发现孕囊非常小，可能无法清晰观察到，甚至不到7毫米，这可能与女性月经周期的长度有关，例如月经周期不规律，一次周期超过40天。在这种情况下，建议一周后进行再次B超检查，以便由专业的妇产科医生进行准确的分析和诊断。

总之，怀孕5周时孕囊的大小通常为7毫米左右。如果孕囊过小或无法清晰观察到，建议进行阴道彩超检查，并在需要时进行复查以获得更准确的诊断结果。请咨询专业的妇产科医生以获取更多指导和建议。