根据您描述的症状，每天早晨起来肚子痛，很有可能是由于胃部出现了炎症和溃疡，以及泌尿系统部位出现结石的原因导致的。对于十二指肠溃疡的患者来说，疾病的影响也容易诱发肚子部位的疼痛。

为了明确疾病的具体病因，我们可以采取以下方式进行检查：

1. 白带化验：通过检查白带样本，可以排除或确认是否存在与泌尿系统相关的感染或炎症。

2. 胃镜检查：通过胃镜检查，可以直接观察胃部是否存在炎症和溃疡，以确定是否与胃部问题相关。

3. 大便化验：通过检查大便样本，可以排除或确认是否存在与消化系统相关的疾病，如消化道感染或炎症。

以上检查方法可以帮助我们明确疾病的具体病因，从而制定合理的治疗方案。请您及时就医，以便进行进一步的诊断和治疗。