藿香正气水的治疗效果还是比较不错的，但需要注意，由于每个人的体质及病情程度不同，对药物的敏感性也不相同，若在用药一段时间后治疗效果不太理想，应及时停药就医，以免延误病情。另外，在安全性上，正常剂量服用藿香正气水一般很少发生不良反应。但由于每位患者的体质、用药情况等差异，用药后若出现不适，应去医院就诊。

藿香正气水不建议用来洗头，如果是用于治疗头癣，可以涂搽患处。藿香正气水当中含有很多酒精，所以有一定的刺激性，如果用于洗头，很容易刺激头皮，引发过敏现象，很有可能会出现头皮瘙痒、红肿、起疹子等表现，有时候也会加重头皮干燥、脱皮，因为酒精有一定的挥发作用，会挥发掉头皮表面的水分。另外，酒精挥发的时候，会感觉头皮凉凉的，如果没有做好保暖工作，就容易导致头部受寒，引起感冒。

藿香正气水口服常用于外感风寒、内伤湿滞或夏伤暑湿所致的感冒，以及胃肠型感冒，表现为怕冷、头痛、头昏、胸闷、呕吐、腹泻、腹胀以及周身沉重等。此外还可以外用，治疗头癣、手足癣、灰指甲、足癣、外阴瘙痒、湿疹、蚊虫叮咬、白癜风、婴幼儿腹泻等。