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使用免疫抑制剂治疗特应性皮炎会有一定的危害。在治疗特异性皮炎的过程中，医生常用的免疫抑制剂有环孢素、甲氨蝶呤、硫唑嘌呤等。
1、环孢素：本药是应用最多的免疫抑制剂，其不良反应有高血压、肾毒性等。所以，如果患者有高血压或肾病史，则需避免使用该类免疫抑制剂；如果患者可以使用该类免疫抑制剂，需在治疗过程中，严密监控血压和肾功能的指标，而且当病情控制后，不能突然停药，需逐渐减量直至停药。通常环孢素的治疗疗程不可超过两年。
2、甲氨蝶呤：本药相对较为安全，其不良反应有造血功能异常、肝肾损害。通常医生会在患者用药前，询问是否有肝病史、饮酒史等。如果患者存在肝功能、血常规异常时，则需避免使用该类免疫抑制剂；如果患者可以使用该类免疫抑制剂，需在治疗过程中，严密监测血常规和肝肾功能，一旦出现白细胞、红细胞、血小板下降，或肝肾指标异常等，则需及时停药，以防出现严重危害。
3、硫唑嘌呤：本病的不良反应有骨髓抑制、生殖毒性和肿瘤等。所以，患者在用药前，需进行巯基嘌呤甲基转移酶活性检测，如果患者的酶活性下降或者缺失，则无法应用该类免疫抑制剂；即便患者的酶活性正常，也需从小剂量开始逐渐增加治疗剂量，而且在用药期间，还需严密监测血常规，一旦出现白细胞、红细胞、血红蛋白、血小板下降，则需立即停药。需注意的是，如果有肿瘤史、肿瘤家族史、或者近期备孕的患者，是不能使用硫唑嘌呤的。
在临床上，任何药物都会存在一定的不良反应，而免疫抑制剂的不良反应相对较多。所以，患者需遵医嘱使用免疫抑制剂，以保证治疗的安全性。